婴儿肾囊肿并没有最佳的治疗方法，需要根据肾囊肿的大小、严重程度对症治疗，可以进行非手术治疗或手术治疗。

1.非手术治疗。婴儿出现肾囊肿后需及时就医，了解肾囊肿的大小，如果肾囊肿比较小，而且没有明显的症状产生，一般可以暂时不必处理，但是需要定期随访检查，以免对婴儿的身体发育造成影响。

2.手术治疗。如果婴儿肾囊肿比较大，出现疼痛、肿胀等各种问题，需要及时就医进行手术治疗，切除肾囊肿，以免对婴儿的后期生长发育造成影响。